MySQL的存储架构由三个主要的组成部分组成：MySQL Server、存储引擎和物理存储。
MySQL Server
MySQL Server是MySQL的核心组成部分，它包含许多重要的功能，比如SQL解释器、查询优化器、权限管理、日志记录、网络通信、索引管理等等。MySQL Server通常是一个长期运行的进程，可以与多个客户端进行通信和交互。
存储引擎
MySQL提供了许多不同的存储引擎，每个存储引擎都有其独特的特点和性能优势，这使得用户可以根据其应用程序的特定需求选择不同的存储引擎。MySQL的默认存储引擎是InnoDB，还有诸如MyISAM、Memory、CSV、Blackhole等等存储引擎。
物理存储
MySQL数据的物理存储是指如何将数据保存到磁盘上，以便在需要的时候可以快速地检索和访问。MySQL中有多种不同的文件格式，这些格式基于不同的存储引擎和具体问题的要求创建。例如，InnoDB存储引擎使用.ibd文件和.ib_logfile文件，而MyISAM存储引擎则使用.frm文件和.MYD和.MYI文件。
在一次MySQL查询中，查询的优化器将根据查询的类型、数据分布和其他因素，选择最有效的存储引擎和路径来执行查询。因此，在MySQL中选择合适的存储引擎和优化查询非常重要。