01. 锁MyISAM 只支持表级锁(table-level locking)，也就是任何 CRUD 的操作都会给表加上锁，而 InnoDB 则支持表级锁和行级锁(row-level locking)，默认是行级锁。
Innodb 的行级锁又分几种：共享锁(S)，排它锁(X)，意向共享锁(IS)，意向排他锁(IX)；如果 SQL 语句没有使用索引，并且又不能确定操作的行，这个时候就会锁表；即使在查询条件中使用了索引字段，但是如果 MySQL 认为全表扫描的效率更高，这时候也会使用表锁，所以还是要通过执行计划确认是否真正使用到了索引。
02. 事务MyISAM 强调的是性能，但是不支持事务；
Innodb 是支持事务的，事务级别包括未提交读(Read uncommitted)，已提交读(Read committed)，可重复读(Repeatable read)，可序列化(Serializable)；
而不支持事务可能会导致：数据更新丢失、脏读、不可重复读等等；另外事务可以保障数据库崩溃后的安全恢复。
03. 外键MyISAM 不支持外键，Innodb 支持外键。
04. 数据库文件MyISAM 的数据库文件属于堆表，每个表在磁盘上都有三个文件，frm(存储表定义)、myd（存储表数据）、myi（存储表索引）；
InnoDB 分为表空间数据文件和日志文件；其中数据文件用于保存数据和索引，它又有两种存储方式，共享表空间存储和多表空间存储；如果是共享表空间，那么所有表的数据文件和索引文件都保存在同一个表空间中，如果是多表空间，那么每个表都有一个表空间文件，用于存储数据和索引。
05. 索引MyISAM 使用非聚集索引，也就是索引和数据分开存储，索引保存的是数据文件的指针；也就是说，主键索引和非主键索引的叶子节点都是数据文件的指针。
InnoDB 使用聚集索引，也就是索引和数据存在一个文件中；必须要有主键；不过如果使用非主键索引的话，需要两次查询，先查询到主键，然后再通过主键查询到数据；也就是说，主键索引的叶子节点是数据文件，非主键索引的叶子节点是主键的值。
另外着重指出，InnoDB 必须有主键，MyISAM 可以没有。
06. count()MyISAM 保存有表的总行数，如果使用 select count(*) from table，直接取出该值，效率更高；
InnoDB 没有保存表的总行数，如果使用 select count(*) from table，需要遍历整个表；
当然如果是加了 where 条件的话，两种引擎都需要进行扫描。
偶将持续分享Java开发、架构设计、程序员职业发展等方面的见解，希望能得到你的关注。