网站的目录是指你建立网站时创建的目录。目录的结构是一个容易忽略的问题，大多数站长都是未经规划，随意创建子目录。目录结构的好坏，对浏览者来说并没有什么太大的感觉，但是对于站点本身的上传维护，内容未来的扩充和移植有着重要的影响。下面是建立目录结构的一些建议：
●不要将所有文件都存放在根目录下。
有网友为了方便，将所有文件都放在根目录下。这样做造成的不利影响在于：
1.文件管理混乱。你常常搞不清哪些文件需要编辑和更新，哪些无用的文件可以删除，哪些是相关联的文件，影响工作效率。
2.上传速度慢。服务器一般都会为根目录建立一个文件索引。当您将所有文件都放在根目录下，那么即使你只上传更新一个文件，服务器也需要将所有文件再检索一遍，建立新的索引文件。很明显，文件量越大，等待的时间也将越长。所以，给您的建议是：尽可能减少根目录的文件存放数。
●按栏目内容建立子目录。
子目录的建立，首先按主菜单栏目建立。例如:网页教程类站点可以根据技术类别分别建立相应的目录，象Flash,Dhtml,Javascript等；企业站点可以按公司简介，产品介绍，价格，在线定单，反馈联系等建立相应目录。
其他的次要栏目，类似what’s new，友情连接内容较多，需要经常更新的可以建立独立的子目录。而一些相关性强，不需要经常更新的栏目，例如：关于本站，关于站长，站点经历等可以合并放在一个统一目录下。
所有程序一般都存放在特定目录。例如：CGI程序放在cgi-bin目录。便于维护管理。所有需要下载的内容也最好放在一个目录下。
●在每个主目录下都建立独立的images目录。
默认的，一个站点根目录下都有一个images目录。刚开始学习主页制作时，阿捷习惯将所有图片都存放在这个目录里。可是后来发现很不方便，当偶需要将某个主栏目打包供网友下载，或者将某个栏目删除时，图片的管理相当麻烦。经过实践发现：为每个主栏目建立一个独立的images目录是最方便管理的。而根目录下的images目录只是用来放首页和一些次要栏目的图片。
●目录的层次不要太深。
目录的层次建议不要超过3层。原因很简单，维护管理方便。
其它需要注意的还有：
1.不要使用中文目录；网络无国界，使用中文目录可能对网址的正确显示造成困难。
2.不要使用过长的目录；尽管服务器支持长文件名，但是太长的目录名不便于记忆。
3.尽量使用意义明确的目录；上面的例子中，你可以用Flash,Dhtml,Javascript来建立目录，也可以用1，2，3建立目录，但是哪一个更明确，更便于记忆和管理呢？显然是前者！