先举个例子，如果你了解一下csv格式和txt格式就会发现，csv格式只不过是使用txt格式并把内容按照表的分列用逗号隔开了而已（然后换了个扩展名）。
那么，要设计一种文件格式，如果只是你自己用，那你想怎么存就怎么存、按什么顺序存信息你自己决定就可以了，扩展名最好不要跟常用的一样，然后保证你的程序能读出文件内容就好。
然后大家试试更进一步，要使你自己设计的这个格式有区分性，比如，你可以要求扩展名必须为wdgs，然后这个文件第一行头四个字节必须是542B（16进制）。为什么要这样做？这是为了区分同样叫wdgs的扩展名的文件究竟是不是你的文件。
然后如果按照工程角度的设计出发，后面一般会跟文件格式版本用的几个字节，你也可以考虑设计上去，这是为了如果以后你修改了你的文件格式，还能根据版本用不同的解析方法把文件内容读出来。
再然后还是按照工程角度出发，可以考虑加上记录文件总大小用的几个字节，这是为了当一个文件涉及网络传输或拷贝等时，你还能大概判断这文件是不是完整。
接下来的部分，就看你拿这文件干什么了。如果只是存键值对组合，那直接存就行了，加些标签存也可以（这方面的例子参见XML和JSON的文件格式，XML有些在头部还有明文的版本号、适用标准等等信息，json一般就只存实质内容了，就是那些键值对，甚至格式也直接用符号来区分了，标签也省了。html文件也是这样的例子）。
如果是要存图片，那可以把像素逐个解析出来按颜色存储，事实上，这就是BMP文件格式的做法。
看到bmp可能你又考虑jpg、png这些，这些是涉及了压缩算法的，所以实际存在文件里时，要把文件分节分段，然后一节存图片本身的像素摘要信息，一节存插值算法的摘要信息等等（你不明白的话，可以这样考虑：偶要存10000000000这个数，那么偶可以存成“10000000000”，也可以存成“1后十个0”对吧，显然后者比前者短了，也就是减小了文件大小）
有了分节分段这些策略以后，存个视频什么的都不是问题了，可以把视频存成一帧一帧的（事实上原始格式的avi就是这样），依次类推。
这样，你只要考虑你要存哪些东西，这些东西怎么转变为有序的数字/文字/字节（事实上最终都是字节）以供你存的时候能记住、取的时候不会乱，这样就能设计出你需要的文件格式了。
你要是乐意，也可以要求你的文件必须以你的名字+万岁的UTF8编码为结束才能被认可，哈哈，只要大家认可这格式就行。所谓你写的程序，规则是你定的。