Python的优势：Python相对于Matlab最大的优势：免费。
Python次大的优势：开源。
你可以大量更改科学计算的算法细节。可移植性，Matlab必然不如Python。
但你主要做Research，这方面需求应当不高。
第三方生态，Matlab不如Python。比如3D的绘图工具包，比如GUI，比如更方便的并行，使用GPU，Functional等等。
长期来看，Python的科学计算生态会比Matlab好。语言更加优美。
另外如果有一定的OOP需求，构建较大一点的科学计算系统，直接用Python比用Matlab混合的方案肯定要简洁不少。
Matlab的优势：Community. 目前学校实验室很多还用Matlab，很多学者也可能都用Matlab。交流起来或许更加方便。
Matlab本来号称更快，但实际上由于Python越来越完善的生态，这个优势已经逐渐丧失了。总结来说就是python开源免费，有丰富的第三方库，比较适合实际工程，matlab是商业软件如果买了的话做学术研究不错， 如果混合编程比较麻烦。