存储文件在数据库中的优势：
1. 数据库备份方便：将文件存储在数据库中，可以将文件和数据库一起备份，方便管理和维护。
2. 数据库事务支持：如果文件存储在数据库中，可以利用数据库的事务机制来保证文件的完整性和一致性。
3. 数据库权限控制：将文件存储在数据库中，可以利用数据库的权限控制机制来限制用户对文件的访问权限，提高数据安全性。
存储文件在数据库中的劣势：
1. 数据库性能问题：将文件存储在数据库中，会占用数据库的存储空间，导致数据库性能下降。
2. 数据库备份时间增加：如果文件较大，将文件存储在数据库中，会增加备份的时间和复杂度。
3. 数据库维护成本增加：将文件存储在数据库中，会增加数据库的维护成本，包括存储空间的管理、备份和恢复等。
存储文件在磁盘上的优势：
1. 数据库性能优化：将文件存储在磁盘上，可以减轻数据库的存储压力，提高数据库的性能。
2. 数据库备份方便：将文件存储在磁盘上，可以将文件和数据库分开备份，减少备份的时间和复杂度。
3. 数据库维护成本降低：将文件存储在磁盘上，可以减少数据库的维护成本，降低存储空间的管理、备份和恢复等成本。
存储文件在磁盘上的劣势：
1. 数据库事务支持：如果文件存储在磁盘上，无法利用数据库的事务机制来保证文件的完整性和一致性。
2. 数据库权限控制：将文件存储在磁盘上，无法利用数据库的权限控制机制来限制用户对文件的访问权限，降低数据安全性。
3. 文件路径管理：将文件存储在磁盘上，需要管理文件的路径，避免文件路径不正确导致文件无法访问。
综上所述，MySQL存储文件的方式有优劣之分，具体应该根据实际情况选择适合的存储方式。如果文件较小，可以将文件存储在数据库中；如果文件较大，可以将文件存储在磁盘上。同时，应该注意数据库的性能和安全性，以及文件路径的管理。