ZendOptimizer（ZendGuard）：
1、ZendGuard只能对带有PHP标记或源码的文件进行加密，对于其他不带有PHP标记的文本方式保存的文件不能进行加密操作。
2、ZendGuard只能用于配置了ZendOptimizer的环境中，不能独立运行。
3、ZendGuard在PHP4下的错误，对于PHP4的绝对路径及相对路径在加密时会出现较大的差别。
4、支持PHP4.2.X~5.2.X版本的加密。
5、使用的ZendOptimizer（PHP引擎）可以提高源码20~50%以上的速度优化，结合ZendGuard可以提高至50%以上的性能速度优化，且ZendOptimizer可以安装于当前较多主流系统中。
ionCube：
1、ionCube不仅可以加密带有PHP标记或源码的php文件还可以对非php文件的以text方式保存的文件进行加密操作，如xml,js,css等。（但是读写时必须使用ionCube所提供的读入API进行读写操作。）
2、ionCube在功能方面经过测试可以优胜于Zend公司的ZendGuard，不仅支持期限，注册码，等加密方式，还支持对IP，MAC地址等复杂的加密方式。
3、可加密的PHP版本从PHP4.0.6~5.2.X（比ZendGuard高2个级别）。
4、ionCube与Zend一样，为了提高PHP性能优化也提供了相应的PHP引擎，可以为大多数操作系统提供PHP优化功能，但是可惜的是，至今未提供Windows版本的PHP引擎。
5、ZendGuard在PHP4下的错误，在ionCube中没有出现，可以看出ionCube相对稳定。
6、对于ionCube来说，对带有PHP标记或源码的文件采用压缩加密方式处理，对于非php的文本类文件则采用加密方式处理。在读入时必须使
用“ioncube_read_file/ioncube_write_file”读写文件。因此在使用ionCube加密前需要对相应的PHP代码，进行改造后才能使用。
可以看出对于ionCube与ZendGuard来说各有优缺点，因此在选择产品时需要根据项目及代码情况来决定采用何种工具进行处理。
关于二者更加详细的比较，请看下图：